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青岛，科技日报2月6日讯——6日，青岛海洋科技先导国家实验室(以下简称海洋先导国家实验室)得到好消息:为加快新型冠状病毒药物筛选进程，海洋先导国家实验室在“蓝色药库”研发基础上，利用全国科学家贡献的海洋天然产物信息，通过生物信息学分析，研究病毒基因的保守性。结合知识图谱技术收集相似的蛋白质结构信息，病毒配体Spike蛋白、病毒受体ACE2蛋白、病毒蛋白酶PLpro(木瓜蛋白酶样蛋白酶)和Mpro(3C样蛋白酶或主蛋白酶)、介导病毒核糖核酸帽甲基化修饰的nsp16、与病毒转录和复制相关的RDRP(核糖核酸依赖型核糖核酸聚合酶)和潜在病毒用来干扰宿主免疫的X结构域蛋白，有7个药物筛选目标。通过同源建模和分子动力学模拟，构建了可直接用于虚拟药物筛选的目标口袋。
据海洋试点国家实验室科研人员介绍，上述数据和信息已于2月2日向全社会开放和共享。
据不完全统计，从开放到2月6日的四天时间里，近100个单位从国内外高校、医药企业和科研院所注册和下载。据分析，目前对7个目标模型的关注是不一样的。从下载频率来看，斯派克蛋白的“RBD”目标目前具有较高的关注度，其他6个目标的关注度基本相似。
共享信息发布后，许多研究机构和制药公司的科研和工程技术人员与海洋试点国家国家实验室的科学家就虚拟药物筛选、筛选数据分析、药物计算软件的开发和应用以及化合物的药理学研究等方面进行了深入交流和讨论。他们提出了许多有益的建议，探讨了合作机制和方式，并进一步推动了相关的后续工作。
为了打赢这场新型冠状病毒疫情防控战争，海洋先导国家实验室将继续充分发挥多学科交叉、大平台、大协作的优势，不断拓展药物症状分子筛查数据库。目前，针对病毒靶标的分子对接和分子动力学模拟计算正在深入开展。预计将获得2000多种初始化合物，分子和细胞水平的生物测量验证将加快。这些数据和信息海洋试点国家实验室将加快向全社会开放和共享，以促进预防和控制药物的研发进程。(记者王)
(原名称:海洋试点国家实验室:开放共享抗新型冠状病毒药物筛选虚拟模型)
责任:吉爱玲
