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武汉大学联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序(NTS)检测方法,可大幅提高病毒的阳性检出率,实现新型冠状病毒等10大类、40种常见呼吸道病毒的同时检测和病毒突变的一日监测。 《科学日报》记者近日从武汉大学获悉,该校联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序(NTS)检测方法,可大幅提高病毒的阳性检出率,实现一天内同时检测新型冠状病毒等10种主要类型和40种常见呼吸道病毒及病毒突变。3月7日,该团队在预先打印的平台medRxiv上正式发表了一篇研究论文,题为“通过纳米孔靶向测序对新冠状病毒和其他呼吸道病毒的准确和全面检测”。

武汉大学开发出10分钟内检测新冠状病毒的新方法

据了解,过去实时荧光定量核酸扩增检测系统(qPCR)主要用于新冠状病毒的诊断,但该方法显示出较低的灵敏度。此外,qPCR核酸检测不能同时检测其他秋冬季发病率较高且引起类似新皇冠肺炎症状的呼吸道病毒,给疫情防控和患者分流管理带来巨大挑战。

武汉大学药学院的刘天刚教授、武汉大学人民医院的李燕教授、武汉镇西医学实验室有限公司的俞利拉地教授和首席执行官傅爱思博士迅速组成联合团队,创新性地开发了纳米孔靶向测序检测方法。

该团队开发的NTS技术的特征在于,它不局限于中国或美国疾病控制中心目前推荐的qPCR方法中的位点,而是将检测范围扩展到9个基因、12个位点和近10,000个碱基(10kb)区域,覆盖了病毒基因组上的所有主要基因区域,覆盖了100%与病毒基因组上的毒力相关的重要基因。 病毒基因组的检测范围比目前广泛使用的qPCR高100倍,显著提高了检测的灵敏度和准确性。

武汉大学开发出10分钟内检测新冠状病毒的新方法

刘天刚介绍说,qPCR就像用狙击枪打样本中的病毒核酸一样,而且有一定的失手概率,而NTS并没有使用狙击枪,而是同时撒网和撒网,从而大大提高了捕捉病毒核酸的概率。不仅如此,它还能在捕获病毒核酸的同时读取其序列。这样,一项检测不仅可以确认新的冠状病毒是否被感染,还可以确认其他常见的呼吸道病毒,包括呼吸道合胞病毒、冠状病毒、腺病毒、副流感病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒和丙型流感病毒等。,可同时检测,为医生分诊提供了明确的依据。更重要的是,该方法还可以检测与毒力相关的基因在病毒传播过程中是否发生突变,从而为后续的流行病学分析快速提供信息。

武汉大学开发出10分钟内检测新冠状病毒的新方法

在这项研究中,该团队同时测试了NTS和qPCR。结果显示,NTS从45名临床高度怀疑的新型冠状病毒感染患者中鉴定出34份阳性样本,比qPCR多15份。在16例临床确诊的新型冠状病毒感染患者中,nts全部检测为阳性。临床确诊样本显示,NTS的阳性率比qPCR高43.8%。

此外,NTS可以在测序后仅10分钟内检测到高浓度病毒样本。即使是极低浓度的病毒样本,测序后4小时内也能完成检测。从收到样品到发布结果,整个过程控制在6-10小时内。此外,这项技术所需的纳米孔测序平台不需要很高的实验室要求。MinION是最小的音序器,可移植,所以NTS也更适合不同级别的医院。(记者通讯员吴、)

责任:吉爱玲

31704008,。武汉大学开发新方法,最快在10分钟内检测出新的冠状病毒。2020-03-12 10:53:17,. 204501,.纪爱玲

来源:彭博新闻网

标题:武汉大学开发出10分钟内检测新冠状病毒的新方法

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